Отличительной чертой современного образования является научно-исследовательская деятельность учащихся. К такому, казалось бы, простому выводу пришел и коллектив школы № 3, пришел путем анализа успехов, трудностей и перспектив развития своего учреждения. В сравнении с типовой программой общеобразовательной школы сегодняшний день требует не только более высоких учебных результатов, но и в не меньшей степени - поиска новых возможностей для повышения эффективности образования в контексте становления новой культуры общественных отношений.
Школа пошла по пути организации поисково-исследовательской работы учащихся и педагогов. Ведущая цель этого направления - развитие творческих способностей обучающихся в различных областях познания и деятельности через формирование навыков самостоятельного научного поиска. Под руководством опытных наставников из числа педагогов школы, поисковиков, ветеранов ребята приобщаются к историческому, национальному, патриотическому потенциалу страны. "Социальное исследование как одна из форм изучения истории родного края" - такое исследование провела А. Карье, ученица 9 класса. С данной работой и многими другими имеют возможность ознакомиться все заинтересованные учащиеся школы № 3.
В 2006 году ветераном афганской войны С. П. Бойковым на базе школы № 3 была сформирована группа инициативных ребят, которые собирали сведения о событиях на территории Торопецкого района в годы Великой Отечественной войны. В 2008 году основывается отряд из обучающихся 9 класса, они проводят поисковые работы в д. Захаркино Понизовского сельского поселения. В марте 2009 года на базе школы создан поисково-исследовательский отряд "Память". Руководитель отряда - педагог т.п. Кучанова, командир - Н. Ульянов, ученик 10 класса. В состав отряда входят учащиеся 6-10 классов, педагоги: А. Н. Муштуков, Л. В. Михайлова, Н. М. Ветров. Отряд тесно сотрудничает с районным поисковым отрядом научно-исследовательского центра "Подвиг". Его руководитель С. П. Бойков является куратором в поисково-исследовательской работе.
Главным итогом деятельности отряда стала летняя экспедиция в д. Мартисово, в ходе которой были обнаружены и торжественно захоронены останки 16 советских воинов, погибших при освобождении Торопецкого района. Затем отрядом были найдены останки еще трех воинов Красной армии, погибших в боях осенью 1941 года. Участвовали и в поисках в д. Колдино, найденные останки бойцов были захоронены на Братском кладбище города. В ходе экспедиций отрядом были обнаружены личные вещи воинов, которые вошли в экспозицию школьного музея.
В школе № 3 действуют программы и подпрограммы нравственно-патриотического воспитания: "Мы этой памяти верны", "О подвигах, о доблести, о славе", "Мы - дети России", а также акции: "Забота" - по оказанию посильной помощи людям пожилого возраста; "Обелиск" - по благоустройству захоронений на Братском кладбище, вручению георгиевских лент ветеранам Великой Отечественной войны. Выездная агитбригада школы выступала перед ветеранами сельских поселений и военнослужащими войсковых частей. Проводились: военно-патриотический месячник, конкурс рисунков и стенгазет "Никто не забыт, ничто не забыто", ретро-фестиваль "Песни в солдатских шинелях", поэтический конкурс "Фронтовая поэзия", лекторий "Овеяны славой наш флаг и герб" и многие другие мероприятия патриотической направленности.
Следствием этой работы стало создание школьного музея. Он основан и оформлен самими учащимися, конечно, под чутким руководством педагогов. Открытие школьного музея состоялось недавно, но работа по накоплению материала для оформления музейной экспозиции началась задолго до этого. Руководит музеем Л. В. Михайлова, заведующая библиотекой. Музей является неотъемлемым звеном школьного образовательного процесса. Помощь в его создании оказал Л. В. Кулаковский, возглавляющий Торопецкое лесничество. Учащиеся школы № 3 и педагоги благодарны Леониду Владимировичу за поддержку.
Большая часть экспозиции музея посвящена Великой Отечественной войне. Здесь постоянно проводятся экскурсии как для учащихся школы № 3, так и для гостей, ведут их старшеклассники Н. Ульянов и А. Филиппова. Гости школы после экскурсий оставили немало положительных и даже восторженных отзывов о музее.